در شکل، علامت رعد و برق سبز، نور تحریک است. دایره های سبز فلوروفور، دایره های قرمز تیره خاموش کننده و دایره های سیاه خاموش کننده تیره هستند. دایره خاکستری بزرگ یک پلیمراز با فعالیت اگزونوکلئازی ´5 به ´3 است. مربع های سیاه نازک مسدود کننده هستند و استوانه های نارنجی رنگ متصل شونده به شیارکوچک هستند.
الف- رنگ های متصل شونده به DNA دو رشته ای افزایش قابل توجهی در فلورسانس هنگام اتصال به DNA نشان می دهند.
ب- پروب های هیدرولیز بین پروب فلورسنت و خاموش کننده توسط فعالیت پلیمراز شکسته می شوند که منجر به افزایش فلورسانس می شود.
پ- پروب های هیبریداسیون دوگانه هنگام هیبرید شدن با انتقال انرژی تشدید تغییر رنگ می دهند.
ت- molecular beacon hairpin فلورسانس را تا زمان اتصال هدف که خاموش کننده را از فلوروفور جدا می کند، خاموش می کند.
ث- پروب های Scorpion در ترکیب اصلی خاموش می شوند، اما هنگامی که حلقه اصلی سنجاق سر به محصول توسعه دهنده آن هیبرید می شود، فلورسانس افزایش می یابد.
ج- پروب های خاموش کننده تیره در ابتدا توسط یک بایندر شیار کوچک و خاموش کننده تیره خاموش می شوند. هیبریداسیون به هدف باعث آزاد شدن فلورسانس می شود.
چ- رشته کوتاه پروب های نیمه دو رشته ای در حضور هدف جابه جا می شود و فلورسانس را از خاموش شدن آزاد می کند.
منبع: Henry’s Clinical Diagnosis and Management by Laboratory Methods 24th Edition